文件與工作區

多標籤頁、檔案樹、可摺疊大綱與資訊豐富的狀態列，讓寫作脈絡始終井然有序，又不搶走注意力。

多標籤頁

每個標籤頁分別保存游標、選區、捲動、復原/重做、預覽、大綱和派生 Markdown 快取狀態。
再次開啟已開啟的 Markdown 或純文字檔時會聚焦既有標籤頁，而不會建立重複標籤頁。
從檔案樹、拖放、最近開啟或「檔案 → 開啟」開啟檔案時，會在安全的情況下（圖片標籤頁、沒有修改的未命名文件或其他未修改的文件）使用目前標籤頁，否則開啟新標籤頁；有未儲存修改的文件永遠不會被靜默取代。

v0.2.8 在存在未儲存修改時提供儲存 / 不儲存 / 取消三種選擇。儲存會先寫入相關文件，未命名文件使用「另存新檔」；不儲存會放棄修改並清理對應還原快照；取消保留目前工作。結束時，一次確認涵蓋所有未儲存標籤頁。

「開啟資料夾」可切換工作區根目錄，並在「檔案」側邊欄中依目錄層級巢狀顯示以下內容；空資料夾也會列出：

Markdown 檔（在檔案樹中保持醒目區分）
精選的純文字檔：.txt, .text, .log, .csv, .tsv, .org, .rst, .adoc/.asciidoc，以 UTF-8 文字開啟
支援的圖片檔：.png, .jpg/.jpeg, .gif, .webp, .bmp, .tif/.tiff, .svg，以唯讀圖片標籤頁開啟，超大圖片會適配到內容區域內顯示

展開資料夾時只顯示下一層的子項，可逐層深入查看深層巢狀的工作區。
「顯示隱藏檔案/資料夾」偏好設定（預設關閉）可顯示點號開頭（dotfile）以及帶 Windows 隱藏屬性的項目；而始終排除的建置、相依與 VCS 雜訊目錄（target, node_modules, .git 等）在任何情況下都保持隱藏。
右鍵選單會依目標提供開啟、在新標籤頁開啟、新增檔案/資料夾、重新命名、刪除、複製絕對路徑、複製工作區相對路徑、在系統檔案總管中顯示、篩選和重新整理等操作。
檔案和資料夾可就地命名；刪除非空資料夾需要二次確認。
可在檔案樹中拖曳任意檔案或資料夾，放到目標資料夾、資料夾內的檔案上或工作區根目錄來完成磁碟移動；受影響的已開啟標籤會自動對應到新路徑。也可從作業系統檔案總管將 Markdown 檔直接拖入 Markion。
「檔案」和「大綱」面板均可切換顯示，側邊欄與分欄預覽的分隔線可拖曳調整，檔案與大綱面板均提供可拖曳的捲軸。Markion 會記住視窗大小、螢幕位置、最大化狀態、側欄寬度與分欄比例，並在下次啟動時安全還原。

「大綱」面板以可摺疊樹狀結構列出文件標題層級：含有下層標題的標題會顯示展開/摺疊控制項，新開啟的文件大綱預設完全展開。摺疊狀態依文件獨立、僅作用於目前工作階段，並會醒目顯示游標所在章節。點選標題會跳到對應原始碼位置——在閱讀模式下則跳到對應的繪製標題。

原生視窗標題顯示目前檔名，並在未儲存時加上 *。狀態列顯示儲存狀態、瞬間操作回饋與以下脈絡：

原子寫入。 文件寫入採用同目錄的原子取代，寫入失敗時保留文件路徑和髒狀態，不會遺失編輯內容。
外部變更偵測。 Markion 會追蹤最近已知的磁碟檔案識別，在儲存前及文件開啟期間偵測外部變更：僅自動重新載入乾淨文件，並為髒文件提供重新載入、覆寫或另存副本的衝突選擇。
自動儲存。 預設在停止輸入五秒後寫入還原快照。可在「偏好設定 → 一般」調整 1–300 秒延遲，或關閉「靜默儲存」以保留還原快照而不覆寫原檔；未命名文件始終只寫還原副本。已還原的還原快照會保持持久，直到成功儲存、明確捨棄或被原子寫入的後繼還原所取代。
還原管理員。 列出每個還原快照及其原始路徑和磁碟關係，支援還原、捨棄、全部還原與全部捨棄，且不會刪除無法讀取或未選取的還原資料。